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医疗保健与生命科学

新药研发高性能计算解决方案指南

借助云端资源和简单易用的用户界面,高效处理大数据、执行复杂模拟,大幅提升新药研发效率。

概览

在制药行业的新药研发场景下,研究人员和制药公司面临着处理海量生物数据、执行复杂模拟的挑战,传统以命令行方式执行的高性能计算 (HPC) 环境对药物研发机构使用门槛高,管理运维复杂,为解决这一痛点,该指南提供了简单易用的图形化界面帮助用户快速构建药物研发 HPC 集群以及部署蛋白质结构预测、虚拟筛选、分子动力学模拟等药物研发常用计算应用,大幅降低系统的运维和使用成本,提升新药要发效率。该指南基于 Amazon API GatewayAmazon LambdaAmazon ECR 等服务构建。

客户应用场景

通过直观 Web UI,研究人员无需命令行,即可轻松创建和管理用于分子动力学模拟、蛋白质结构预测等分子建模任务的 HPC 集群 —— 一站式管理多个分子建模集群,提高研发效率。

根据药物研发工具的动态负载需求,可在UI上快速扩缩集群的 CPU/GPU 等资源 —— 按需灵活分配计算资源,加速药物研发数据分析,节省成本。

优化集群架构和调度策略,充分释放计算资源以加速虚拟筛选过程 —— 实时监控作业队列和资源利用情况,确保关键分子优化任务高效运行。

基于不同新药项目,创建逻辑隔离的HPC资源池 —— 个性化定制每个项目的模拟参数和算法,加速创新。

架构图及说明

步骤

1

第 1 步

用户登录系统,通过图形化界面配置集群,提交创建请求。

2

第 2 步

系统将集群创建请求发送至集群管理的 Amazon API Gateway

3

第 3 步

Amazon API Gateway 调用 Amazon ParallelCluster API 创建集群

4

第 4 步

用户通过 SSM 登录集群头节点,提交作业。

5

第 5 步

集群根据作业需求创建计算节点,完成计算任务。

6

第 6 步

通过 NICE DCV 以远程桌面的方式登录头节点,对计算结果进行可视化分析