概览
在制药行业的新药研发场景下,研究人员和制药公司面临着处理海量生物数据、执行复杂模拟的挑战,传统以命令行方式执行的高性能计算 (HPC) 环境对药物研发机构使用门槛高,管理运维复杂,为解决这一痛点,该指南提供了简单易用的图形化界面帮助用户快速构建药物研发 HPC 集群以及部署蛋白质结构预测、虚拟筛选、分子动力学模拟等药物研发常用计算应用,大幅降低系统的运维和使用成本,提升新药要发效率。该指南基于
Amazon API Gateway、
Amazon Lambda、
Amazon ECR 等服务构建。
客户应用场景
通过直观 Web UI,研究人员无需命令行,即可轻松创建和管理用于分子动力学模拟、蛋白质结构预测等分子建模任务的 HPC 集群 —— 一站式管理多个分子建模集群,提高研发效率。
根据药物研发工具的动态负载需求,可在UI上快速扩缩集群的 CPU/GPU 等资源 —— 按需灵活分配计算资源,加速药物研发数据分析,节省成本。
优化集群架构和调度策略,充分释放计算资源以加速虚拟筛选过程 —— 实时监控作业队列和资源利用情况,确保关键分子优化任务高效运行。
基于不同新药项目,创建逻辑隔离的HPC资源池 —— 个性化定制每个项目的模拟参数和算法,加速创新。
架构图及说明
步骤
1
第 1 步
用户登录系统,通过图形化界面配置集群,提交创建请求。
2
第 2 步
系统将集群创建请求发送至集群管理的
Amazon API Gateway
3
第 3 步
Amazon API Gateway 调用 Amazon ParallelCluster API 创建集群
4
第 4 步
用户通过 SSM 登录集群头节点,提交作业。
5
第 5 步
集群根据作业需求创建计算节点,完成计算任务。
6
第 6 步
通过 NICE DCV 以远程桌面的方式登录头节点,对计算结果进行可视化分析