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新药发现解决方案

此亚马逊云科技解决方案有何用途 ?

生命科学的价值链正在经历现代化,以减少开发和生产药物的时间与成本。一种新药的商业化成本估计为 25 亿美元,其中 25% 的成本被认为是由实验室效率低下造成的。该解决方案能够促进团队协作和内部药物发现,提供最先进的化学模拟软件,实现用于运行基因组学或药物发现研究工作负载的 HPC 环境,依托多个亚马逊云科技服务来处理大量数据,并利用 AI/ML 服务构建模型以挖掘更多价值。

方案优势

按需部署,方便快捷

一键式按需部署的计算集群。方便快捷的配置方法及流程,适配多种计算机型。

基于最佳实践的软件封装

自动安装 Schrodinger 软件包,支持亚马逊云科技公开数据集引用分析,支持 Amazon SageMaker 二次分析计算结果。

自定义工具流,灵活掌控

支持 Shell 基本流程,支持 KNIME Workflow 面向新药研发三件套。

解决方案架构及说明

以下架构图展示了整个方案的部署架构。(可单击图片放大查看)

图1:基于 Amazon Batch 构建容器化 Gromacs 计算环境
  1. 上传输入文件到 Amazon S3
  2. 触发计算事件。
  3. 根据不同的计算任务需求,投递到不同计算实例类型计算。
  4. 调取软件 docker 镜像,例如 Gromacs。
  5. 计算过程中中间结果文件与 Amazon S3 交互。
  6. 利用 Amazon S3 文件生命周期归档智能管理不同类型文件。

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